اهداف برنامه ثبت بیماری:
1- ارتقاء ارائه خدمات درمانی و آموزشی به بیماران و گروه های هدف ثبت
2-     ایجاد بستر مناسب جهت تولید شواهد ارزیابی وضعیت خدمات پیشگیری، درمانی و مدیریتی در سیستم سلامت دانشگاه
3-     توسعه زیر ساخت‏های لازم جهت راه اندازی و استقرار نظام ثبت بیماری‏ها و پیامدهای سلامت
4-     توسعه ارتباطات بین المللی و همکاری با برنامه های بین المللی ثبت بیماری‏ها
5-    کسب مهارت‏ها و دانش فنی جهت اجرای طرح‏های دانشگاهی، ملی و بین المللی مبتنی بر ثبت بیماری‏ها
6-    ایجاد بستر مناسب جهت توسعه کمی و کیفی تحقیقات علوم پزشکی
7-     شبکه سازی و ارتقاء همکاری های بین متخصصی و گروههای تحقیقاتی دانشگاه و کشور
8-     اطلاع رسانی و ترویج برنامه های ثبت موجود در دانشگاه